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07-252024
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仿刺參腐皮綜合征病原燦爛弧菌RPA-Cas13a檢測方法的建立
摘要:為預防和控制燦爛弧菌引發(fā)的仿刺參腐皮綜合征,促進仿刺參養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,利用LwCas13a中特異性CRISPR RNA(crRNA)與靶RNA結(jié)合后可激活Cas13a蛋白對外源RNA分子附屬切割活性的特征,結(jié)合重組酶介導的聚合酶擴增技術(shù)(RPA),建立1種針對燦爛弧菌gyrB基因的快速、靈敏、特異的定量檢測方法——RPA-Cas13a。RPA-Cas13a可實現(xiàn)在37℃恒溫下、60 min內(nèi)對燦爛弧菌的快速實時檢測。靈敏度測試結(jié)果顯示,RPA-Cas13a檢測限為550拷貝/μL(gyrB),與熒光定量PCR的檢測靈敏度水平一致;特異性測試結(jié)果表明,RPA-Cas13a對創(chuàng)傷弧菌、哈維氏弧菌、鰻弧菌等其他弧菌及產(chǎn)黑假交替單胞菌、嗜水氣單胞菌、遲緩愛德華氏菌等常見水產(chǎn)動物病原菌均無交叉反應,特異性較強。RPA-Cas13a方法對仿刺參體表黏液(32份)、養(yǎng)殖池塘水體(15份)和表層沉積物(10份)等57份環(huán)境樣本的陽性檢出率為8.77%,與傳統(tǒng)熒光定量PCR方法的檢出一致性高(Kappa=1.00),無統(tǒng)計學差異(P>0.05)。試驗結(jié)果表明,燦爛弧菌的RPA-Cas13a新型定量檢測方法,快速簡便、靈敏特異,可為預防和控制仿刺參腐皮綜合征的發(fā)生提供有力的分子工具。 


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